가장 대표적인 것이 1990년대 이후 컴퓨터 성능의 급속한 발전과 더불어 도입된 '분자설계기술'이다.
이 분자설계기술은 신약개발 전 과정에서 큰 역할을 하고 있다.
신약개발 과정은 질병의 원인에 관련된 유전자 및 단백질(질병표적물질)을 찾아내고 그 표적물질에 작용하는 또 다른 물질(약물:저분자화합물)을 찾아내는 과정이다.
이는 크게 연구 단계와, 전임상~임상 실험기간을 거쳐 신약으로 승인을 받고 제품화 및 판매에 이르는 개발단계로 나뉜다.
연구단계에서의 분자설계기술은 신약으로서의 가능성을 갖는 화합물들을 설계함으로써 신약개발의 비용과 시간을 줄이는 데 기여하고 있다.
컴퓨터 기반의 분자설계기술은 신약개발을 위한 표적 물질들(단백질 DNA RNA 등)과 표적물질에 작용하는 약물 후보 화합물을 눈으로 볼 수 있도록 보여준다.
또 약물이 작용하는 중요한 자리(활성자리)를 밝혀주며 어떤 작용에 의해 약물이 효과를 나타낼 수 있는지를 계산해 예측한다.
이를 통해 실험자들에게 화합물 합성을 위한 아이디어를 제공하거나, 혹은 독창적으로 설계된 화합물 구조를 제공하기도 한다.
이때 주로 사용되는 방법은 크게 표적물질의 구조를 아는 경우와 그렇지 못한 경우로 나뉜다.
전자를 '표적단백질기반 분자설계'라 부르고, 후자를 '리간드(단백질에 작용하는 저분자화합물)기반 분자설계'라 부른다.
연구단계 초기에는 이들 정보를 바탕으로 한 가상 탐색방법을 통해 효율적이고 신속하게 초기 유효물질을 도출할 수가 있다.
분자설계기술은 무작위적이고 직관적인 화합물 합성을 통해 신약을 개발하려던 기존 방법을 획기적으로 개선했다.
즉 분자수준의 상호작용을 가상공간에서 미리 살펴봄으로써 합리적 화합물 설계가 가능해졌기 때문이다.
또 화학 · 생물정보학을 활용한 분자설계기술은 다량의 실험데이터 분석을 통해 약물로서 가능성을 가진 화합물들의 물리화학적 성질(용해도 막투과도 이온화도 친소수성 등)을 실험을 거치지 않고서도 정확하게 예측할 수 있도록 도와준다.
이와 함께 약으로서 우리 몸에 들어가 원하는 작용지점까지 흡수될 것인지, 체내에서 분포는 적합한지, 인체에 흡수된 약물은 배설이 잘 되는지, 몸속에 존재하는 다른 물질들이나 반응에 의해 대사가 될 것인지 등에 대한 약동력적 성질들과 인체에 해로운 독성은 없는지도 파악이 가능하다.
이를 '인실리코 예측 기술(in silico prediction technology)'이라 부른다.
지구상에 이론적으로 존재할 수 있는 저분자화합물의 수는 1000여개 정도로 알려져 있다.
그러나 최근에는 고효율 합성기술을 통해 단기간 내 수십만개의 화합물 합성이 가능해졌다.
또 고효율 약물검색기술을 통한 생물학적 활성 검증으로 단시간에 많은 데이터를 확보할 수 있는 첨단기술들이 신약개발 과정에 적용되고 있다.
강남숙 한국화학연구원 신약개발연구센터 책임연구원은 "앞으로 화학 생물학 수학 통계학 전산학 등이 어우러진 컴퓨터 기반 화학생물정보기술이 탄생해 수많은 데이터 가운데 알곡만을 추려내는 작업이 더없이 쉬워질 것으로 본다"고 말했다.
화학연은 내년 선진 다국적제약사나 삼성병원 분자이미징센터 등 극소수만이 보유하고 있는 '분자이미징 장비'를 도입할 예정이다.
전임상 단계에서 약물 효과 검증은 항상 대상 동물을 죽이고 나서 장기를 해부해 실시한다.
그러나 분자이미징기술은 해부가 필요 없이 약물 투입과 분포 과정을 실시간으로 추적하는 첨단 장비다.
화학연은 이와 함께 전임상 전 정제(tablet)모양이 약물전달 효과를 충분히 낼 수 있게 만들어졌는지 검증하는 'DDS시스템'도 구축할 예정이다.
한편 컴퓨터 자동설계기술은 약품개발뿐 아니라 모든 제조업에 적용된다.
1996년 2월 체스 역사상 최고의 선수로 평가받던 세계 챔피언 가리 카스파로프는 새로운 상대의 도전을 받는다.
도전자는 IBM이 개발한 슈퍼컴퓨터 딥블루(Deep Blue)이다.
체스 역사상 최고실력자인 그는 딥블루를 이겼지만 이듬해 5월에 치러진 2차전에서 컴퓨터에 패했다.
이는 컴퓨터가 단순하고 반복적인 계산만이 아닌 인간처럼 창의적 사고도 할 수 있는 가능성을 보여준 사건이다.
자동설계기술은 한마디로 설계하고 싶은 문제를 주면 컴퓨터가 알아서 최적의 답을 주는 기술이다.
자동설계기술을 이용하면 왜 아치(arch)형 다리가 가장 견고한 다리인지 한번에 알 수 있다.
자동설계기술의 핵심은 컴퓨터가 자동으로 설계를 할 수 있는 능력, 즉 인공지능을 구현하는 일이다.
자동설계기술은 전기기계시스템은 물론 고강성경량 차체, 고출력고음질 스피커, 고효율 흡음재 설계 등 그 응용 분야가 무궁무진하다.
예를 들면 흡음재 설계의 경우 특정 소재가 특정 환경과 주파수대에서 얼마나 효율적인 흡음률을 보이는지 한번에 설계해준다.
서울대 기계항공공학부 멀티스케일설계 창의연구단(단장 김윤영 기계항공공학부 교수)은 인공지능을 구현해 컴퓨터 자동설계시스템을 업그레이드하는 연구를 9년간 진행 중이다.
연구단은 '원하는 조건과 성능만 제시하면 컴퓨터가 자동으로 설계해주는 자동설계기술'을 개발하고 있다.
제품을 설계하기 위해서는 여러 가지 물리현상 -파괴현상, 발열현상, 전자기현상 등을 동시에 고려해야 하기 때문에 수많은 시행착오 없이 최적의 설계를 한다는 것은 사실상 불가능하다.
그러나 연구단이 개발하고 있는 자동설계기술은 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 모든 설계 조건을 고려하면서도, 단시간에 제품을 설계해 내는 기술로 시행착오 없이 최적의 제품을 설계할 수 있도록 지원하는 기술이다.
연구단은 광저장기기의 구동장치， 초음파센서， 방열구조물， 흡음재， 에너지 수확장치 등에 자동설계기술을 적용해 혁신적 설계물을 만들고 있다.
![[Science] 컴퓨터가 설계를한다?…신약개발 이끄는 '분자 설계 기술'](https://img.hankyung.com/photo/201012/2010120908911_2010121010301.jpg)
